Химик РУДН уточнил принцип действия ферментов, создающих омега-6 жиры

Химик РУДН уточнил принцип действия ферментов, создающих омега-6 жиры

Химик РУДН определил, что принцип действия некоторых ферментов, которые создают жизненно необходимые для человека жирные кислоты омега-6, отличается от принятого биохимиками представления. Эти ферменты создают дополнительную двойную связь в углеродной цепочке жирной кислоты. Оказалось, что они «отсчитывают» нужное место не с концов цепочки, как считалось ранее, а от уже имеющейся двойной связи.

Жирные кислоты — длинная цепочка атомов углерода с ответвлениями. На одном ее конце находится карбоксильная группа (COOH), на другом — метиловая (CH3). Некоторые атомы углерода могут быть соединены не одинарной связью, а двойной — такие кислоты называются ненасыщенными. Их принято называть по положению двойных связей, считая с метилового или с карбоксильного конца. В первом случае название помечают буквой омега, во втором — дельта. Например, в вакценовой кислоте единственная двойная связь находится у 7 атома углерода с метилового кольца или у 11 — с карбоксильного, поэтому в ее названии значится или ω7, или Δ11. Предполагается, что ферменты, которые добавляют новые двойные связи в цепочку, так же «отсчитывают» нужный атом углерода с одного или с другого конца. Химик РУДН впервые показал, что для некоторых ферментов, производящих жизненно необходимые жиры омега-6, это не так.

«Ферменты крайне чувствительны к положению и геометрической конфигурации вновь введенных двойных связей. Как они ведут свой подсчет — это давний вопрос, на который пока нет четкого ответа. Хотя и предполагается, что подсчет идет от метилового или карбоксильного конца, точного понимания этого механизма еще нет. Мы показали, что как минимум для некоторых ферментов подсчет ведется не так, как считалось ранее», — Сергей Горяинов, заведующий лабораторией масс-спектрометрии и спектроскопии ЯМР высокого разрешения Центра коллективного пользования РУДН.

Ферменты, которые создают двойные связи в цепочках жирных кислот, называются десатуразы. Каждая десатураза предназначена для создания кислоты с двойной связью только у конкретного атома углерода. Например, десатураза омега-6 создает двойные связи только у шестого атома углерода, считая с метилового конца. Химики показали, что для жирных кислот с несколькими двойными связями ферменты «отсчитывают» нужный атом не с конца цепочки, а от положения уже имеющейся двойной связи. Сделать это удалось на примере десатураз омега-6, полученных из бактерий двух видов — Gloeobacter violaceus и Synechocystis.

Клеточные культуры двух видов бактерий вырастили на твердой питательной среде, а затем переместили в жидкой среду, где выделили их ДНК. Также химики измерили состав жирных кислот в бактериях. Чтобы точно определить положение двойной связи, химики использовали масс-спектрометрию. Все эти процедуры повторили не менее трех раз. Сравнив наличие генов, кодирующих десатуразы, и состав жирных кислот, химики сделали вывод, как десатуразы определяют нужный атом углерода в цепочке. Оказалось, что эти ферменты отсчитывают от двойной связи три атома углерода в сторону метилового конца цепочки и там создают двойную связь.

«Наши результаты показывают, что обактериальные Δ12 (ω6) десатуразы ведут отсчет от уже существующей двойной связи, а не от концов. При этом длина цепи не имеет значения», — Сергей Горяинов, заведующий лабораторией масс-спектрометрии и спектроскопии ЯМР высокого разрешения Центра коллективного пользования РУДН.

Результаты опубликованы в журнале Biochimie.

Новости
Все новости
Наука
12 марта
Звание почётного профессора РУДН присвоили заместителю президента РАН Талии Хабриевой

На расширенном заседании Ученого совета РУДН звание почетного профессора университета было присвоено Талии Ярулловне Хабриевой, выдающемуся российскому юристу и государственному деятелю.

Талия Хабриева — директор Института законодательства и сравнительного правоведения при Правительстве РФ, академик Российской академии наук, возглавляет Отделение общественных наук РАН. Она стала первой и единственной женщиной-вице-президентом Российской академии наук за 300-летнюю историю РАН.

Наука
12 марта
Против плоскоклеточного рака головы и шеи: учёная РУДН защитила диссертацию и стала кандидатом медицинских наук

Ассистент кафедры гистологии, цитологии и эмбриологии медицинского института РУДН, научный сотрудник НИИ молекулярной и клеточной медицины Энар Джуманиязова успешно защитила диссертацию и стала кандидатом медицинских наук сразу по двум специальностям: «Клеточная биология» и «Онкология, лучевая терапия».

Наука
6 марта
Увидеть освоение Луны и поехать в отдалённые уголки Арктики: женщины-учёные РУДН рассказали о своих мечтах

В преддверии 8 Марта мы решили рассказать о некоторых женщинах-ученых РУДН. Сотрудницы вуза поделились с нами, какими достижениями они больше всего гордятся, почему выбрали научную карьеру и о чем мечтают.