В 15 лет ушел из дома и добрался до г. Баку, поступил на работу на нефтепромыслы учеником телефониста-монтера. Там же познакомился с И.В. Джугашвили (И.В. Сталиным). В 1918 году участвовал в выпуске газеты «Искра», в феврале 1918 года вступил в Красную Армию.

Активно участвовал в Гражданской войне — защищал Царицын, командовал взводом, а завершил Гражданскую войну командиром эскадрона на Закавказском фронте после установления там Советской власти. Член РКП(б) с 1924 года.

В 1922 году Сергей Худяков окончил 2-е кавалерийские курсы усовершенствования командного состава в Тифлисе, с 1924 года работал начальником полковой школы, а затем (1928—1931) — начальником штаба червонно-казачьего кавалерийского полка в Изяславе (ныне Хмельницкой области). Там в 1928 году женился на Варваре Петровне Леляк.

В 1936 году, блестяще окончив командный факультет Военно-Воздушной Академии РККА имени Н. Е. Жуковского, майор Худяков отправляется в Белорусский военный округ на должность начальника оперативного отделения штаба авиабригады. В 1937 году стал начальником оперативного отделения штаба ВВС, а в 1938 — начальником тыла управления ВВС.

Период Великой Отечественной войны

Великая Отечественная война застала полковника Худякова Сергея Александровича в должности начальника штаба ВВС Западного Особого военного округа. Он был участником битвы за Москву — уже в должности командующего ВВС Западного фронта (под командованием Г. К. Жукова).

В 1942 году по проекту генерал-майора Худякова Ставкой Верховного Главнокомандования было принято решение о создании (вместо военно-воздушных сил фронтов) воздушных армий. Это новшество давало возможность, сконцентрировав под единым началом командующего воздушной армией всю фронтовую авиацию, наносить удар на нужном участке фронта. Сергей Александрович получил назначение начальником штаба ВВС Красной Армии, а через месяц, 18 июня 1942 года, принял командование 1-й воздушной армией Западного фронта.

В 1943 генерал-полковник Сергей Худяков координировал боевые действия авиации Воронежского и Степного фронтов в Курской битве и в битве за Днепр. 

В августе 1944 года Сергей Александрович Худяков стал начальником штаба и заместителем командующего ВВС Красной Армии, координировал действия авиации до полной победы в битве за Днепр. Блестяще проявил себя в Ясско-Кишиневской операции. 

В августе 1944 года Указом Президиума Верховного Совета СССР Худякову Сергею Александровичу было присвоено звание маршала авиации.

В феврале 1945 года в составе советской делегации маршал авиации Худяков в качестве советника по авиации участвовал в работе Ялтинской конференции Большой тройки. 

В марте 1945 года приказом Верховного Главнокомандующего Худяков был назначен командующим 12-й Воздушной армией, входившей в состав Забайкальского фронта. В последующем, приняв командование военно-воздушными силами Дальневосточного военного округа, сражавшимися против войск императорской Японии, активно участвовал в разработке уникальной воздушно-десантной операции, во время которой был взят в плен император Маньчжоу-Го Пу И.

Репрессии и расстрел

В 1945 году организовал высадку десанта в Маньчжоу-Го, арестовал императора Пу И и захватил золотой запас Маньчжурии. 

14 декабря 1945 года был арестован в Чите и доставлен в Москву, где ему было предъявлено обвинение по статье 58-1 «б» УК РСФСР (измена Родине). 

18 апреля 1950 года Сергей Александрович Худяков был приговорён к высшей мере наказания — расстрелу с конфискацией имущества, и в тот же день расстрелян. Прах захоронен в общей могиле на Донском кладбище.

Реабилитация

В соответствии с Указом Президиума Верховного Совета СССР от 27 марта 1953 года об амнистии, семье Худяковых разрешили вернуться в Москву из ссылки в Красноярском крае.

В августе 1954 года в Главной военной прокуратуре началось надзорное рассмотрение материалов архивно-следственного дела № 100384. Военный прокурор, осуществлявший надзор, вынес заключение о внесении архивно-следственного дела на повторное рассмотрение Военной коллегии Верховного Суда СССР с предложением отменить приговор в связи с вновь открывшимися обстоятельствами. В этом служебном документе впервые назывались настоящие фамилия, имя и отчество маршала — Ханферянц Арменак Артемович.

При повторном рассмотрении дела Военной коллегией Верховного суда было установлено, что обвинение Худякова-Ханферянца никакими объективными данными не подтверждено.

18 августа 1954 г. Военная коллегия Верховного Суда СССР определением № 4н-09087/54 постановила: приговор от 18 апреля 1950 г. в отношении Худякова Сергея Александровича, он же Ханферянц Арменак Артемович, отменить по вновь открывшимся обстоятельствам и дело о нём за отсутствием состава преступления производством прекратить.

Указом Президиума Верховного Совета СССР от 6 июля 1965 года реабилитированный по решению суда С.А. Худяков был посмертно восстановлен в воинском звании маршала авиации и в правах на награды. Чуть позже партийная комиссия при Главном политуправлении Советской Армии и ВМФ восстановила маршала авиации Худякова в рядах партии.

Основные награды:

• Орден Ленина;
• Два ордена Красного Знамени;
• Орден Суворова 1-й степени;
• Орден Кутузова 1-й степени;
• Орден Суворова 2-й степени;
• Орден Красной Звезды;
• Орден Знак Почета;
• орден Почётного легиона (Франция);
• военный крест 1939—1945 с пальмовой ветвью (Франция).

Роман Авакович Ханферьян,
профессор кафедры иммунологии и аллергологии МИ РУДН